69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3092 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 450 aa  861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  84.62 
 
 		 454 aa  615  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  87.58 
 
 		 451 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  73.01 
 
 		 450 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  79.65 
 
 		 449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  79.34 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  75.4 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  74.56 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  81.33 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  77.11 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  73.89 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  71.93 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  75 
 
 		 453 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  75 
 
 		 453 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  67.56 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  67.63 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  59.61 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  63.17 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  65.1 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  67.93 
 
 		 390 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  59.67 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  57.72 
 
 		 407 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  51.46 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  52.12 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  64 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  53.45 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  51.71 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  51.43 
 
 		 444 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  50.67 
 
 		 457 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  48.28 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  47.74 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  66.16 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  66.54 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  60.96 
 
 		 418 aa  336  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  47.71 
 
 		 450 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  62.45 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  62.45 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  50.65 
 
 		 460 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  48.71 
 
 		 456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  48.71 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 459 aa  315  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  57.14 
 
 		 459 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  57.14 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  56.78 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  58.24 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  46.65 
 
 		 449 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  43.62 
 
 		 387 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  57.14 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  58.24 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  56.51 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  37.64 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.58 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  30.71 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.83 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.11 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.74 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  63.83 
 
 		 70 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.16 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  24.6 
 
 		 534 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.2 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.5 
 
 		 647 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25.32 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 2570 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  23.05 
 
 		 541 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>