72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3697 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 461 aa  871    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  69.13 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  57.7 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  54.23 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  55.25 
 
 		 448 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  54.88 
 
 		 436 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  57.92 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  56.98 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  58.57 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  58.33 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  58.33 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  56.4 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  75.29 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  54.33 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  54.88 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  65.95 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  55.28 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  53.8 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  69.31 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  54.69 
 
 		 414 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  60.82 
 
 		 401 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  66.43 
 
 		 429 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  62.9 
 
 		 457 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  65.43 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  62.04 
 
 		 420 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  65.7 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  48.69 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  64.62 
 
 		 390 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  65.8 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  45.88 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  49.24 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  60.22 
 
 		 450 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  60.22 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  50.25 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  58.76 
 
 		 459 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  59.49 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  48.2 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  59.12 
 
 		 459 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  58.76 
 
 		 463 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  59.49 
 
 		 461 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  58.76 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  59.5 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  59.12 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  59.49 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  58.03 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  58.76 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 457 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  57.25 
 
 		 387 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  45.06 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  36.73 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.07 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.59 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  33.81 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  30.74 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.35 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.63 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.81 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  28.1 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25.12 
 
 		 541 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  28.37 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1175  hypothetical protein  23.12 
 
 		 527 aa  50.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  47.83 
 
 		 70 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25.24 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  24.78 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  27.11 
 
 		 342 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  26.02 
 
 		 534 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  42.86 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.32 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>