56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0601 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 
407 aa  767    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  96.39 
 
 
429 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  83.15 
 
 
454 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  56.79 
 
 
450 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  61.98 
 
 
468 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  60.79 
 
 
401 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  59.78 
 
 
451 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  57.27 
 
 
454 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  54.89 
 
 
450 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  56.15 
 
 
448 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  58.44 
 
 
449 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  59.51 
 
 
390 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  56.22 
 
 
450 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  58.16 
 
 
452 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  57.65 
 
 
450 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  70.7 
 
 
414 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  57.14 
 
 
449 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  57.71 
 
 
453 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  57.71 
 
 
453 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  51.66 
 
 
419 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  65.45 
 
 
420 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  55.72 
 
 
407 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  53.53 
 
 
387 aa  358  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  63.25 
 
 
457 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  50.23 
 
 
444 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  49.67 
 
 
450 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  49.67 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  61.95 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  65.8 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  49.76 
 
 
450 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  62.83 
 
 
451 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  48.97 
 
 
438 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  63.1 
 
 
461 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  61.54 
 
 
459 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 
461 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  63.88 
 
 
426 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 
457 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  58.74 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  38.77 
 
 
437 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.71 
 
 
426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.24 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.85 
 
 
396 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  29.15 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.6 
 
 
409 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  57.14 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  66.67 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  53.7 
 
 
70 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.79 
 
 
463 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  48.91 
 
 
450 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  27.17 
 
 
547 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  25.65 
 
 
534 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  40.82 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  24.39 
 
 
541 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.75 
 
 
647 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  25.1 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>