70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2905 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 444 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  77.88 
 
 		 450 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  82.74 
 
 		 450 aa  594  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  80.09 
 
 		 450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  77.56 
 
 		 457 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  75.43 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  70.28 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  70.26 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  72.08 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  69.83 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  71.58 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  67.83 
 
 		 456 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  72.89 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  72.55 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  58.56 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  82.05 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  81.68 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  84.56 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  82.72 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  53.06 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  51.43 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  63.25 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  52.05 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  65.33 
 
 		 414 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  51.48 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 451 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  49.33 
 
 		 431 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  51.14 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  50.11 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  49.77 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  52 
 
 		 439 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  61.59 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  64.29 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  48.4 
 
 		 419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  48.86 
 
 		 448 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  51.14 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  51.52 
 
 		 451 aa  335  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  64 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 449 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 453 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 453 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  63.21 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  62.14 
 
 		 450 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 387 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  62.14 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  61.07 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  58.64 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  47.51 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  44.19 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  56.68 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  56.47 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  56.18 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  42.95 
 
 		 449 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.13 
 
 		 437 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  34.56 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.74 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  32.47 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  30.69 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.9 
 
 		 409 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.26 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.54 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  25.98 
 
 		 534 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25.47 
 
 		 398 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.58 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  25.11 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  27.48 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  22.12 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  26.44 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>