26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0763 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 394 aa  784    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  26.77 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  26.69 
 
 		 534 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.24 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  24.8 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  19.47 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.81 
 
 		 577 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.81 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.81 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.9 
 
 		 647 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  26.69 
 
 		 483 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25.71 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  24.9 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.46 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.86 
 
 		 550 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.77 
 
 		 437 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  26.04 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.34 
 
 		 532 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  23.53 
 
 		 540 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.71 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.3 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  26.27 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.4 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  24.72 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  24.5 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  19.49 
 
 		 473 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>