66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1614 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 493 aa  967    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  33.57 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  36.47 
 
 		 647 aa  153  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  30 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.3 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.97 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  28.36 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  27.18 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  27.71 
 
 		 398 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  24.16 
 
 		 534 aa  90.1  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  23.39 
 
 		 473 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.16 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  24.34 
 
 		 368 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.78 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  28.78 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.71 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.69 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  25.6 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  27.05 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.09 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  29.23 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  29.5 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.03 
 
 		 532 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  27.63 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.94 
 
 		 577 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.28 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.3 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.3 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.15 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  26.29 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.99 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  27.78 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  27.63 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.55 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  25.77 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  25.79 
 
 		 449 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  24.22 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  26.59 
 
 		 453 aa  53.5  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  26.59 
 
 		 453 aa  53.5  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  27.38 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  26.98 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  28.74 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  25.79 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.85 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  25.79 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  26.19 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  25.39 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  27.21 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  26.17 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  26.23 
 
 		 449 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  25.39 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  27.67 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  25.57 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  25.7 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  26.36 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  26.59 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  24.6 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  24.8 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  25.5 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  25.7 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  26.25 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  25.9 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  25.9 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  24.21 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  25 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  25.9 
 
 		 460 aa  43.5  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>