15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1343 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 589 aa  1144    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  99.66 
 
 		 589 aa  1141    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  96.04 
 
 		 563 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  27.84 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.03 
 
 		 647 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.09 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.7 
 
 		 443 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  25.7 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  23.71 
 
 		 384 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  22.76 
 
 		 534 aa  54.3  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  23.32 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.37 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  23.05 
 
 		 368 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  28.23 
 
 		 473 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  22.57 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>