32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4694 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  100 
 
 		 443 aa  882    Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  28.38 
 
 		 534 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.51 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  28.03 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.57 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.57 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.2 
 
 		 577 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.81 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  26.34 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  23.25 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  26.62 
 
 		 540 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.1 
 
 		 532 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.48 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25.89 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.15 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.24 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  25.1 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.39 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  26.69 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.82 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  25.28 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.91 
 
 		 589 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.55 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.14 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  24.55 
 
 		 589 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.69 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  23.9 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.48 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4643  conjugal transfer protein  30 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  21.09 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  20.15 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>