57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0366 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0366  trbL protein  100 
 
 		 547 aa  1064    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  33.55 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  27.7 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  34.84 
 
 		 647 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  27.34 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.13 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.72 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.35 
 
 		 572 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.4 
 
 		 456 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.35 
 
 		 572 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.34 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  28.83 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.78 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.96 
 
 		 443 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  27.51 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  28 
 
 		 384 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  28.73 
 
 		 398 aa  87.8  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  32.28 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  28.47 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  27.96 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  27.4 
 
 		 540 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.7 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  24.7 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0251  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.27 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  27.42 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  25.9 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  29.72 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  28.23 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.69 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  28.12 
 
 		 451 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  25.78 
 
 		 450 aa  50.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  27.16 
 
 		 457 aa  50.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  27.05 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  28 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  25.78 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  27.76 
 
 		 438 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  26.67 
 
 		 449 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  26.88 
 
 		 414 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  27.51 
 
 		 439 aa  47.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.62 
 
 		 532 aa  47.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  26.09 
 
 		 429 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  28.74 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.7 
 
 		 387 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  24.86 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  32.45 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4643  conjugal transfer protein  32.58 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  27.56 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.79 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  26.64 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  26.64 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  26.09 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  26.43 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  27.15 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  25.89 
 
 		 450 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  26.43 
 
 		 450 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  27.27 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  26.51 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>