68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3994 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 429 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  67.9 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  96.39 
 
 		 407 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  57.68 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  61.56 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  59.96 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  59.25 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  55.67 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  59.53 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  59.45 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  58.67 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  57.27 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  62 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  57.59 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  61.02 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  62.44 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  58.85 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  61.16 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  60.4 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  60.4 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  57.73 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  56.82 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  52.76 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  58.98 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  53.05 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  65.09 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  51.27 
 
 		 387 aa  362  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  52.97 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  51.85 
 
 		 407 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  49.67 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  62.19 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  62.96 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  49 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  64.26 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  49.66 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  50 
 
 		 450 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  50.11 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 459 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  63.88 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  64.64 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  61.17 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  62.64 
 
 		 457 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 456 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 460 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 457 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 460 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  59.85 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  46.88 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  39.64 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  36.84 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  34.71 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.48 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  28.78 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.83 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  27.84 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.81 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  57.14 
 
 		 70 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  26.63 
 
 		 547 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25.34 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.75 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  25.98 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  20.97 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>