65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0961 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 468 aa  897    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  70.97 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  55.53 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  53.1 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  52.25 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  70.4 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  53.56 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  53.1 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  70.04 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  55.25 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  54.7 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  53.96 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  50.43 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  50.86 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  46.06 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  52.75 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  53.53 
 
 		 451 aa  335  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  52.46 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  52.46 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  60.29 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  60.65 
 
 		 439 aa  323  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  59.48 
 
 		 419 aa  322  6e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  60.29 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  45.18 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  56.73 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  58.56 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  49.68 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  58.17 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  54.75 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  57.99 
 
 		 431 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  56.41 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  44.52 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  49.56 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  53.71 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  53.48 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  54.58 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  53.85 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  55.68 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  55.28 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  53.48 
 
 		 459 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  54.58 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  55.2 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  53.85 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  53.48 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  52.75 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  53.11 
 
 		 461 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  54.58 
 
 		 457 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  53.9 
 
 		 387 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  41.72 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  55.31 
 
 		 457 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  53.48 
 
 		 460 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  53.48 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  53.48 
 
 		 464 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  36.09 
 
 		 426 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  33.69 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  34.71 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  33.58 
 
 		 483 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  32 
 
 		 396 aa  110  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  30.1 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  25.87 
 
 		 384 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.66 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  23.64 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  28.7 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  23.83 
 
 		 541 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>