69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7747 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 449 aa  857    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  82.82 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  79.29 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  79.33 
 
 		 450 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  78.49 
 
 		 448 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  85.11 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  84 
 
 		 450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  78.85 
 
 		 452 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  78.67 
 
 		 451 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  80.13 
 
 		 451 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  75.22 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  78.76 
 
 		 449 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  78.76 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  78.76 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  70.73 
 
 		 440 aa  504  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  70.89 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  64.75 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  61.47 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  63.17 
 
 		 401 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  65.77 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  83.03 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  62.83 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  57.62 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  53.6 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  53.32 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  65.09 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  56.01 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  52.54 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  66.31 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  65.7 
 
 		 407 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  52.12 
 
 		 444 aa  342  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  65.7 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  61.84 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  50.58 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  68.44 
 
 		 426 aa  339  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  51.65 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  62.75 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  60.44 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  51.27 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 459 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  58.61 
 
 		 456 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  58.24 
 
 		 460 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 460 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  57.88 
 
 		 461 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  59.34 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  60.07 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  59.71 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  48.88 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  57.99 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  54.24 
 
 		 387 aa  292  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  38.32 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  34.08 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.31 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  28.36 
 
 		 483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  32.22 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  27.51 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  62.79 
 
 		 70 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  24.14 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  25.4 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  25.1 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  26.77 
 
 		 547 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  27.42 
 
 		 398 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.78 
 
 		 647 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.14 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  23.94 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>