24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4643 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4643  conjugal transfer protein  100 
 
 		 323 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  42.09 
 
 		 463 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  39.14 
 
 		 534 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2235  P-type conjugative transfer protein TrbL  44.24 
 
 		 456 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0056  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  44.25 
 
 		 473 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6625  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  53.55 
 
 		 572 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6512  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  53.55 
 
 		 572 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4264  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  52.9 
 
 		 577 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.121202  decreased coverage  0.00233607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15540  putative mating pair formation protein TrbL  48.96 
 
 		 540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145282  unclonable  1.75241e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2536  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  52.38 
 
 		 532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.804219  hitchhiker  0.0000361128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1718  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  35.82 
 
 		 550 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685182  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4694  P-type conjugative transfer protein TrbL  28.91 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  29.37 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  35.9 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  26.67 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  32.37 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  25.41 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8328  conjugal transfer protein TrbL  27.2 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  29.58 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  27.91 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  22.3 
 
 		 454 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9653  conjugal transfer protein TrbL  28.15 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.912606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1343  P-type conjugative transfer protein TrbL  33.33 
 
 		 589 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.794081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1642  conjugal transfer protein trbL, putative  33.33 
 
 		 589 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.476386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>