181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0951 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  43.83 
 
 
240 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  43.78 
 
 
255 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  43.28 
 
 
255 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  39.33 
 
 
249 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  40.44 
 
 
245 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  40.12 
 
 
526 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  25.7 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  26.61 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  25.23 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  24.29 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.16 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.91 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.33 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.26 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  31.79 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  24.14 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.95 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  24.41 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  23.55 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  26.59 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.05 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  23.92 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.81 
 
 
291 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  29.05 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  27.81 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.88 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  27.27 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  28.07 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.08 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  26.52 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  27.03 
 
 
306 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  25 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  28.38 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  28.73 
 
 
412 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  25 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.4 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  31.33 
 
 
426 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  27.4 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.19 
 
 
431 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.97 
 
 
431 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.31 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.97 
 
 
431 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 
431 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  23.74 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  32.14 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  29.66 
 
 
400 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  25.33 
 
 
288 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  26.19 
 
 
292 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.95 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  33.11 
 
 
304 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  27.67 
 
 
287 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  28.97 
 
 
400 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.76 
 
 
304 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  28.48 
 
 
597 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  32.05 
 
 
304 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 
304 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  27.61 
 
 
430 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.39 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  31.43 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.61 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.82 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  27.81 
 
 
597 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  30.12 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  28.17 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.43 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  32.05 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  26.14 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
413 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.69 
 
 
304 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.69 
 
 
304 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  29.14 
 
 
312 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3134  sterol desaturase-like  28.3 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.278147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.25 
 
 
380 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  29.03 
 
 
324 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  28.4 
 
 
411 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  28.65 
 
 
328 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  28.48 
 
 
626 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  30 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  30.43 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  25.95 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.09 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 
408 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  26.35 
 
 
386 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  27.05 
 
 
278 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  28.21 
 
 
407 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  29.38 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.38 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  31.43 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  29.57 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.38 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  29.38 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>