248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0617 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  46.84 
 
 		 288 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  48.89 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  31.46 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.29 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  33.71 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.43 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  33.33 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  33.06 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  32.13 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  34.38 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  31.06 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  33.47 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  34.87 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  42.24 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  34.87 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.07 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  30.57 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  35.08 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  34.39 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.99 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.24 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  33.79 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  34.78 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  38.89 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  32.89 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  30.8 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.84 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  30.17 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  31.67 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  28.78 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  33.99 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  34.42 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  37.68 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  38.17 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  31.02 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  31.3 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  31.3 
 
 		 401 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  31.71 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.98 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  28.21 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  25.89 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  26.27 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  32.8 
 
 		 336 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.7 
 
 		 374 aa  85.5  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.74 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.25 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  34.75 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  34.75 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  34.75 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  34.75 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  27.83 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  29.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  29.38 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  28.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  28.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  26.26 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  27.46 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  28.75 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  29.86 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.06 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  29.86 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  28.3 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  26.76 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  27.88 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.17 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  30.72 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  27.87 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  29 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.04 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  34.16 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  24.07 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  29.37 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  27.67 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  28.68 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  25 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  32.87 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  33.77 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  26.32 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  26.44 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  26.03 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  27.27 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  29.22 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.19 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>