253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3510 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  46.67 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  47.45 
 
 
267 aa  224  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  46.06 
 
 
304 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  43.59 
 
 
295 aa  208  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  43.31 
 
 
281 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  49.33 
 
 
270 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  40.86 
 
 
267 aa  204  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  42.5 
 
 
273 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  42.8 
 
 
273 aa  201  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  47.79 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  41.57 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  43.03 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  45.78 
 
 
283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  42.23 
 
 
256 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  39.45 
 
 
265 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  47.35 
 
 
272 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  40.16 
 
 
330 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  40.16 
 
 
330 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  41.73 
 
 
287 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  45.09 
 
 
270 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  41.05 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  37.55 
 
 
292 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  41.96 
 
 
282 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  41.5 
 
 
264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  41.26 
 
 
268 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  39.22 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  36.19 
 
 
274 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  37.9 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  39.61 
 
 
289 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.44 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.89 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  34.16 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  36.84 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.76 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  36.72 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  33.51 
 
 
291 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  28.21 
 
 
278 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  35.26 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  31.39 
 
 
276 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  30.81 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  31.11 
 
 
337 aa  96.3  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.18 
 
 
321 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.51 
 
 
376 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.8 
 
 
374 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  35.81 
 
 
386 aa  89.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  31.36 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.34 
 
 
374 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.34 
 
 
373 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.34 
 
 
373 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.34 
 
 
301 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.22 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.56 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.37 
 
 
413 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.29 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.16 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  31.16 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.33 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  29.53 
 
 
386 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.58 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.03 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  33.79 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  34.48 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  34.48 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  32.28 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  26.98 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  27.59 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  26.64 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.86 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  32.57 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.48 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  27.57 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  30.66 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  31.87 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  29.1 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  27.09 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  28.12 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 
332 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  29.22 
 
 
407 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  72  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  31.25 
 
 
332 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  31.18 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.58 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  27.8 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  28.74 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.91 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  32.45 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  27.22 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  30.26 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  25.91 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  29.07 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  29.59 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  29.83 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>