244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5280 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  94.9 
 
 		 431 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 431 aa  858    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  94.9 
 
 		 431 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  87.01 
 
 		 431 aa  698    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  69.61 
 
 		 411 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  67.79 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  51.18 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  50.56 
 
 		 626 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  49.43 
 
 		 597 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  49.15 
 
 		 597 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  38.67 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  35.46 
 
 		 426 aa  252  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  38.29 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  42.52 
 
 		 319 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  34.79 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  34.89 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  34.32 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  43.21 
 
 		 289 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  32.13 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  35.43 
 
 		 386 aa  200  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  40.86 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  37.16 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  40.96 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  45.61 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  37.29 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  39.73 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  38.49 
 
 		 275 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  42.62 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  40.07 
 
 		 305 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  40.07 
 
 		 305 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  40.07 
 
 		 305 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  39.35 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  40.86 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  39.45 
 
 		 304 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  44.8 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  38.44 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  39.71 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  40 
 
 		 302 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  39.79 
 
 		 304 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  39.1 
 
 		 304 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  48.95 
 
 		 218 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  48.95 
 
 		 218 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  39.5 
 
 		 320 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  39.43 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  47.37 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  40.07 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  40.07 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  38.81 
 
 		 305 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  38.75 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  40.14 
 
 		 314 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  40.36 
 
 		 287 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  40.36 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  42.92 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  40 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  35.19 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  41.11 
 
 		 282 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  39.64 
 
 		 288 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  47.12 
 
 		 297 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  39.58 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  40 
 
 		 287 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  32.2 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  38.83 
 
 		 314 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  36.71 
 
 		 315 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  33.56 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  37.31 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  38.46 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  38.46 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  44.28 
 
 		 314 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  38.87 
 
 		 287 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  38.11 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  37.59 
 
 		 287 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  38.19 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  37.46 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  37.15 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  39.53 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  36.4 
 
 		 315 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  46.97 
 
 		 287 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  40.7 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  44.02 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  38.37 
 
 		 279 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  46.28 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  34.39 
 
 		 377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  45.05 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  36.36 
 
 		 285 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  45.55 
 
 		 284 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  31.31 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  44.06 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  42.4 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  37.11 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  40.25 
 
 		 271 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  37.79 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  30.71 
 
 		 298 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  37.4 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  28.7 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  34.04 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  34.19 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  29.15 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>