238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0387 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  73.87 
 
 		 307 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  66.78 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  68.6 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  55.22 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  54.85 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  54.21 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  49.62 
 
 		 282 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  54.44 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  44.93 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  45.26 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  40.94 
 
 		 326 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  39.58 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  39.22 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  39.07 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  39.07 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  39.07 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  38.71 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  39.07 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  42.97 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  42.13 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  39.73 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  39.04 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  39.71 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  45.99 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  41.92 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  44.39 
 
 		 314 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  46.01 
 
 		 431 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  41.12 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  36.95 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  41.12 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  41.12 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  42.06 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  44.5 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  44.5 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  39.57 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  45.28 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  42.65 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  35.23 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  48.17 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  47.64 
 
 		 431 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  42.19 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  47.12 
 
 		 431 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  42.13 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  49.73 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  43.5 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  39.91 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  41.74 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  40.87 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  39.9 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  38.98 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  35.66 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  40.87 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  39.46 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  41.2 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  41.2 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  39.3 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  42.21 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  39.83 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  40.77 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  41.2 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  42.72 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  46.45 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  48.33 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  43.06 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  42.23 
 
 		 400 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  40.87 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  40.38 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  34.57 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  40.37 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  40.58 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  32.18 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  41.24 
 
 		 626 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  38.92 
 
 		 426 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  38.33 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  39.46 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  35.95 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  42.93 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  38.74 
 
 		 597 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  42.27 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  39.67 
 
 		 597 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  40.1 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  42.2 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  34.45 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  39.41 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  39.41 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  39.41 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  35.18 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  39.76 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  36.36 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  34.87 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  34.42 
 
 		 399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  29.35 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  36.65 
 
 		 374 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  35.4 
 
 		 374 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  37.04 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.48 
 
 		 376 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  35.66 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.39 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  32.24 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>