207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6146 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 337 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  30.74 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  30.67 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  35.58 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  29.62 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.6 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.83 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  29.82 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  33.62 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  32.07 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  32.07 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  32.07 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  31.58 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  26.21 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  32.29 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  28.47 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  32.08 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  33.82 
 
 		 408 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  32.52 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.66 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  28.78 
 
 		 407 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  27.38 
 
 		 317 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  34.54 
 
 		 218 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  34.54 
 
 		 218 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  32.41 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  29.35 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  31.32 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  32 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  32 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  31.53 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  26.07 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  31.17 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.53 
 
 		 426 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.35 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  31.16 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  30.48 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.64 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  26.94 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  32.84 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  28.33 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  29.21 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  26.55 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  29.82 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  29.82 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  31.67 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  30.19 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  29.15 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  28.73 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  32.45 
 
 		 400 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  28.75 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  28.75 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  28.75 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  31.75 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  24.41 
 
 		 412 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  29.84 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  33 
 
 		 288 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  32.5 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  31.12 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  30.69 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  31.28 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  29.9 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  32.5 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  31.53 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  32.5 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  31.34 
 
 		 597 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  30.52 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.43 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  31.34 
 
 		 597 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  28.06 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  30.46 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  30.43 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  28.89 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.41 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  25.89 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  25.53 
 
 		 301 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  26.16 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  29.5 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.5 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  28.63 
 
 		 411 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  24.63 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  30.9 
 
 		 271 aa  89.7  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  28.51 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.46 
 
 		 626 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  27.03 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  27.04 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  27.08 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.41 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  24.38 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.44 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  28.9 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  25.66 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>