242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2023 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  100 
 
 		 322 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  79.46 
 
 		 301 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  79.46 
 
 		 301 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  56.55 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  56.95 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  57.29 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  55.74 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  55.07 
 
 		 304 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  55.07 
 
 		 304 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  56.89 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  54.86 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  54.86 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  54.86 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  53 
 
 		 320 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  54.17 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  52.55 
 
 		 287 aa  285  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  52.55 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  55.91 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  52.92 
 
 		 287 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  54.7 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  55.47 
 
 		 304 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  52.01 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  50.55 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  51.28 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  50.92 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  53.54 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  53.54 
 
 		 288 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  52.4 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  53.52 
 
 		 271 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  50.37 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  54.04 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  52.24 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  47.49 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  58.03 
 
 		 218 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  58.03 
 
 		 218 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  49.79 
 
 		 270 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  41.54 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  42.05 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  41.88 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  41.72 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  41.18 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  44.19 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  37.59 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  39.11 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  39.57 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  39.51 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  38.06 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  41.41 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  36.4 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  36.4 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  39.58 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  39.84 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  37.45 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  38.49 
 
 		 626 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  41.18 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  36.62 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  38.71 
 
 		 412 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  38.11 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  39.62 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  35.6 
 
 		 407 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  36.96 
 
 		 597 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  36.96 
 
 		 597 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  36.36 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  38.52 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  33.46 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  37.11 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  34.57 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  35.56 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  34.28 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  32.76 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  41.43 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  35.81 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  38.82 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  44.44 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  44.44 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  44.44 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  36.46 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  35 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  36.36 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  40.95 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  36.11 
 
 		 431 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  36.11 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  37.56 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  33.72 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  35.98 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  33.86 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  33.2 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.38 
 
 		 402 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  34.62 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  29.27 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  37.07 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  34.41 
 
 		 374 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  33.47 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  31.51 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1297  putative transmembrane protein  79.63 
 
 		 71 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.715305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  29.5 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.1 
 
 		 380 aa  89  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  36.3 
 
 		 281 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0467  hypothetical protein  45.95 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0454844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>