239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1248 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  37.67 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  33.7 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.3 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  36.77 
 
 		 402 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  31.25 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  37.27 
 
 		 412 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  31.33 
 
 		 597 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  31.33 
 
 		 597 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.84 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  34.03 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  34.75 
 
 		 399 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  34.13 
 
 		 376 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  38.97 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  34.38 
 
 		 431 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  36.3 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  34.21 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.89 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  34.57 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  34.57 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  33.52 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.19 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.33 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.12 
 
 		 626 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.36 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  34.75 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  34.19 
 
 		 431 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  33.12 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  35.16 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.62 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  37.16 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  28.8 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  37.8 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  31.65 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  34.38 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  28.85 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  28.5 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.65 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.72 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  30.35 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  32.87 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  37.59 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.17 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  34.03 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  34.03 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  31.68 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  25.53 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  34.03 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  29.68 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  34.75 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.24 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  29.9 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  35.16 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.56 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  30.72 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  33.33 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  31.88 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  31.37 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  29.61 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  31.88 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  31.88 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  28.8 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  31.07 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  31.88 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  30.07 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.07 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  31.37 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.07 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  28.63 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  33.59 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  34.33 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  31.79 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  32.32 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  35.11 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  29.8 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  32.82 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  34.01 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  33.99 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  33.99 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.25 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.79 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  31.36 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.66 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  31.76 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  31.37 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.85 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  31.37 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  31.37 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>