230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4333 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  100 
 
 
407 aa  837    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  60.34 
 
 
407 aa  531  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  51.87 
 
 
402 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  48.53 
 
 
386 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  49.13 
 
 
408 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  49.58 
 
 
399 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  30.68 
 
 
412 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  31.88 
 
 
431 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.13 
 
 
431 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.96 
 
 
431 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.28 
 
 
431 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  33.66 
 
 
304 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
320 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  33.66 
 
 
304 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  32.88 
 
 
400 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  33.66 
 
 
304 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  33.66 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  34.78 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  31.98 
 
 
430 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  35.14 
 
 
304 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  35.14 
 
 
304 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  34.14 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  36.67 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  33.06 
 
 
400 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  28.79 
 
 
411 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  32.97 
 
 
305 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  32.97 
 
 
305 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  32.97 
 
 
305 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  34.35 
 
 
298 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  33.46 
 
 
287 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  32.97 
 
 
303 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  34.68 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.22 
 
 
597 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  34.4 
 
 
597 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  33.46 
 
 
287 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  35.91 
 
 
328 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  33.46 
 
 
287 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  34.34 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  37.74 
 
 
290 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  34.34 
 
 
287 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  40.79 
 
 
298 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  34.72 
 
 
288 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  34.72 
 
 
288 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  32.58 
 
 
287 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  34.72 
 
 
288 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  34.72 
 
 
288 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  29.89 
 
 
626 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.37 
 
 
315 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  34.32 
 
 
314 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  34.09 
 
 
304 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  31.63 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  33.59 
 
 
270 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  34.78 
 
 
326 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  39.04 
 
 
218 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  39.04 
 
 
218 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  33.45 
 
 
310 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  33.09 
 
 
292 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.99 
 
 
314 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  34.08 
 
 
323 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  35.13 
 
 
305 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  33.86 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.73 
 
 
274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  34.03 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  35.47 
 
 
271 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  30.74 
 
 
319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  34.26 
 
 
282 aa  146  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  29.79 
 
 
426 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  32.62 
 
 
291 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  33.84 
 
 
310 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  32.27 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  36.32 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  31.06 
 
 
312 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  34.15 
 
 
312 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  36.71 
 
 
275 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  34.15 
 
 
312 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  31.77 
 
 
289 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  34.15 
 
 
312 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  30.14 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  31.7 
 
 
301 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  41.76 
 
 
305 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  33.48 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  32.87 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  36.6 
 
 
309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  30.63 
 
 
284 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  30.94 
 
 
301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  39.76 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  34.26 
 
 
302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  37.57 
 
 
309 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  33.05 
 
 
374 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  38.12 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  36.07 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  29.15 
 
 
314 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  29.88 
 
 
279 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 
337 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.84 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.7 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.14 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.14 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>