245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3537 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 376 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  84.72 
 
 		 374 aa  668    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  62.87 
 
 		 401 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  62.87 
 
 		 401 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  63.56 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  58.54 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  58.82 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  58.54 
 
 		 373 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  56.85 
 
 		 301 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  41.18 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  41.76 
 
 		 376 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  41.16 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.62 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.2 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  37.99 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.74 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  35.03 
 
 		 275 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  27.82 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  34.44 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  36.41 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  29.29 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  33.06 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  28.21 
 
 		 269 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.67 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.35 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  32.02 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  39.01 
 
 		 272 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  36.11 
 
 		 273 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  35.86 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  35.37 
 
 		 267 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  35.9 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  36.36 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  35.29 
 
 		 270 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  35.37 
 
 		 267 aa  93.6  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3740  hypothetical protein  67.19 
 
 		 84 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.51 
 
 		 259 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  34.27 
 
 		 281 aa  92.8  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.61 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.31 
 
 		 304 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  36.55 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.09 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 		 268 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 		 272 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  26.69 
 
 		 320 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  33.56 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  35.17 
 
 		 295 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  32.35 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  30.7 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  32.61 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  33.11 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  30.87 
 
 		 274 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  28.03 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  34.34 
 
 		 281 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.91 
 
 		 270 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  29.63 
 
 		 287 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  24.15 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  32.28 
 
 		 287 aa  86.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  27.8 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  30.61 
 
 		 287 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  32.21 
 
 		 264 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  27.8 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  36.08 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  34.21 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  26.56 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.8 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  26.56 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  30.18 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.67 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.67 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  30.17 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  33.33 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.76 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  30.24 
 
 		 305 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  28.89 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  28.97 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  28.89 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  35 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  30.52 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  30.21 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.87 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  30.85 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  32.75 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  32.75 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  27.89 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>