252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000349 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  89.3 
 
 
271 aa  510  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  72.95 
 
 
304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  72.28 
 
 
288 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  72.98 
 
 
288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  71.38 
 
 
315 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  71.93 
 
 
288 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  71.58 
 
 
288 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  74.02 
 
 
292 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  73.05 
 
 
287 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  71.73 
 
 
287 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  70.67 
 
 
287 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  69.96 
 
 
287 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  70.32 
 
 
287 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  73.02 
 
 
314 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  70.92 
 
 
287 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  54.38 
 
 
320 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  53.65 
 
 
304 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  54.38 
 
 
304 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  54.01 
 
 
321 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  52.55 
 
 
304 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  52.92 
 
 
304 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  52.4 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  52.19 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  52.19 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  51.82 
 
 
304 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  50.73 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  50.73 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  50.73 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  50.36 
 
 
303 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  47.67 
 
 
274 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  50.54 
 
 
301 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  49.82 
 
 
301 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  46.91 
 
 
270 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  58.42 
 
 
218 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  58.42 
 
 
218 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  42.05 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  41.61 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  40.93 
 
 
319 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  38.99 
 
 
315 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  38.68 
 
 
310 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  43.83 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  42.17 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  41.97 
 
 
400 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  41.7 
 
 
400 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  47.09 
 
 
298 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  42.23 
 
 
304 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  51.85 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  50.26 
 
 
314 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  43.86 
 
 
284 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  48.24 
 
 
289 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  37.89 
 
 
312 aa  185  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  40.23 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  40.15 
 
 
275 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  37.45 
 
 
626 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  40.23 
 
 
297 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  40.94 
 
 
412 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  41.64 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  44.33 
 
 
305 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  39.3 
 
 
297 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  38.24 
 
 
430 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  44.12 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  37.41 
 
 
431 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  37.12 
 
 
431 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  36.74 
 
 
431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  34.34 
 
 
407 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  42.59 
 
 
307 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  36.86 
 
 
597 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  35.84 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  36.47 
 
 
597 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  36.36 
 
 
431 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  35.21 
 
 
306 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  33.09 
 
 
426 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  40.67 
 
 
317 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  42.7 
 
 
309 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  41.54 
 
 
316 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  37.99 
 
 
312 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  37.99 
 
 
312 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  39.06 
 
 
314 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  34.34 
 
 
399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  38.25 
 
 
312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  42.7 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  38.35 
 
 
411 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  32.12 
 
 
402 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  46.32 
 
 
323 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  31.77 
 
 
328 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  39 
 
 
386 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  39.11 
 
 
408 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.44 
 
 
407 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  38.54 
 
 
298 aa  148  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  35.63 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  39.15 
 
 
343 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  40.67 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  40.67 
 
 
374 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  39.33 
 
 
377 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  31.41 
 
 
337 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  32.28 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1297  putative transmembrane protein  64.91 
 
 
71 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.715305  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.32 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.58 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>