248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2540 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
304 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  98.68 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  93.42 
 
 
304 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  90.79 
 
 
304 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  90.79 
 
 
304 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  90.79 
 
 
304 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  86.84 
 
 
304 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  82.39 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  82.39 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  81.91 
 
 
303 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  82.39 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  76.21 
 
 
320 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  76.82 
 
 
321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  82.71 
 
 
218 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  82.71 
 
 
218 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  56.95 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  56.73 
 
 
288 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  50.73 
 
 
274 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  56.93 
 
 
304 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  56.2 
 
 
287 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  56.36 
 
 
288 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  56.57 
 
 
287 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  53.9 
 
 
301 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  56.36 
 
 
288 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  55.84 
 
 
287 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  54.73 
 
 
301 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  56 
 
 
288 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  54.74 
 
 
292 aa  288  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  54.45 
 
 
287 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  55.11 
 
 
287 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  52.1 
 
 
315 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  54.38 
 
 
285 aa  278  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  53.99 
 
 
314 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  54.17 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  54.92 
 
 
271 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  51.1 
 
 
270 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  45.39 
 
 
339 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  43.37 
 
 
282 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  44.4 
 
 
284 aa  215  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  41.26 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  39.22 
 
 
297 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  44.07 
 
 
304 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  47.75 
 
 
314 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  42.34 
 
 
315 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  43.78 
 
 
305 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  42.91 
 
 
412 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  35.08 
 
 
328 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  38.81 
 
 
275 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  43.3 
 
 
307 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  46.99 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  41.2 
 
 
326 aa  195  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  44.44 
 
 
302 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  40.7 
 
 
430 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  36.71 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  37.59 
 
 
290 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  38.96 
 
 
431 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  37.59 
 
 
298 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  40.57 
 
 
400 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  40.57 
 
 
400 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  39.02 
 
 
431 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  38.43 
 
 
312 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  36.82 
 
 
408 aa  185  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  38.49 
 
 
431 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  45.41 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  38.38 
 
 
597 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  39.32 
 
 
431 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  39.91 
 
 
386 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  37.86 
 
 
597 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  35.87 
 
 
310 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  33.66 
 
 
407 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  42.66 
 
 
317 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  38.57 
 
 
306 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  39.82 
 
 
309 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  39.65 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  37.02 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  37.29 
 
 
411 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  36.75 
 
 
314 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  38.63 
 
 
626 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  35.98 
 
 
399 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  37.72 
 
 
314 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  32.97 
 
 
407 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  39.73 
 
 
291 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  39.17 
 
 
309 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  38.52 
 
 
323 aa  165  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  37.76 
 
 
312 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  37.76 
 
 
312 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  37.76 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0467  hypothetical protein  67.86 
 
 
127 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0454844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  34.7 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  32.35 
 
 
426 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  35.05 
 
 
316 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  37.85 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  35.27 
 
 
343 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0601  hypothetical protein  84.81 
 
 
82 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2435  hypothetical protein  84.81 
 
 
82 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  36.33 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  36.48 
 
 
374 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  32.52 
 
 
337 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  33.47 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  33.55 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>