248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2098 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  84.72 
 
 
376 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  100 
 
 
374 aa  753    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  62.47 
 
 
401 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  62.47 
 
 
401 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  61.92 
 
 
385 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  59.66 
 
 
374 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  59.38 
 
 
373 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  59.1 
 
 
373 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  57.53 
 
 
301 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  43.06 
 
 
386 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  43.42 
 
 
380 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  43.7 
 
 
376 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  35.86 
 
 
304 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  33.75 
 
 
293 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
295 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  38.07 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  30.54 
 
 
291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  30.8 
 
 
282 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  35 
 
 
328 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  35.94 
 
 
305 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  32.54 
 
 
256 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  34.46 
 
 
400 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  27.44 
 
 
269 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  33.78 
 
 
274 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  34.73 
 
 
284 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  36.96 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  37.86 
 
 
273 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  34.24 
 
 
268 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.96 
 
 
386 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  29.11 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  40.77 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3740  hypothetical protein  69.84 
 
 
84 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  30.24 
 
 
303 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  27.99 
 
 
284 aa  92.8  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  32.93 
 
 
408 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  30.84 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  34.01 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  33.51 
 
 
287 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  33.71 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  33.52 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.47 
 
 
270 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  35.38 
 
 
267 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  34.29 
 
 
321 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  36.36 
 
 
270 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  36 
 
 
272 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.65 
 
 
259 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30.64 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  32.4 
 
 
305 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  35.42 
 
 
283 aa  89.7  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  29.84 
 
 
324 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  29.84 
 
 
324 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  33.79 
 
 
272 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  35.17 
 
 
267 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  33.1 
 
 
273 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  33.54 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  33.54 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  28.06 
 
 
320 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  33.54 
 
 
305 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  33.13 
 
 
303 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.08 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  30.5 
 
 
322 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  34.53 
 
 
314 aa  87  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  35.71 
 
 
399 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  30.94 
 
 
278 aa  86.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  34.03 
 
 
281 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.13 
 
 
281 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  32.7 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  33.13 
 
 
295 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  32.67 
 
 
287 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  29.92 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  32.5 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  29.92 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  35.67 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.47 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  33.12 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  33.12 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  37.24 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  30.89 
 
 
287 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  26.1 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.5 
 
 
287 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  35.09 
 
 
288 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  33.71 
 
 
287 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  34.3 
 
 
288 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  35.09 
 
 
288 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.47 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  28.72 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  34.33 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.61 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  32.03 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  26.72 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  32.05 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  34.23 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  34.23 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  33.53 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  28.86 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>