249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3807 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  92.33 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  90.94 
 
 		 287 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  90.94 
 
 		 287 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  85.37 
 
 		 288 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  84.67 
 
 		 288 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  84.32 
 
 		 288 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  83.97 
 
 		 287 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  84.32 
 
 		 288 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  77.35 
 
 		 304 aa  477  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  78.37 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  76.66 
 
 		 292 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  76.68 
 
 		 314 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  72.47 
 
 		 287 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  70.92 
 
 		 285 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  74.25 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  54.55 
 
 		 320 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  54.74 
 
 		 304 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  55.11 
 
 		 304 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  54.91 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  54.38 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  54.38 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  53.33 
 
 		 322 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  52.92 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  52.92 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  52.92 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  52 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  52 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  52 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  52.55 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  48.74 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  51.15 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  50 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  46.72 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  45.65 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  58.95 
 
 		 218 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  58.95 
 
 		 218 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  41.26 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  39.86 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  43.33 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  40.43 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  41.45 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  50.52 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  41.45 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  53.44 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  39.26 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  41.43 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  41.48 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  40.42 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  40.8 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  38.73 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  51.56 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  39.43 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  39.18 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  40.14 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  36.4 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  41.74 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  38.87 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  40.29 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2864  sterol desaturase-related protein  41.22 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2908  sterol desaturase-related protein  41.22 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  40.29 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2894  sterol desaturase-related protein  41.22 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  37.09 
 
 		 412 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  45.45 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  39.04 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  39.08 
 
 		 431 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  40.69 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  40.2 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  37.23 
 
 		 431 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  40.87 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  41.04 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  39.71 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  41.15 
 
 		 411 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  38.02 
 
 		 597 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  37.96 
 
 		 626 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  37.4 
 
 		 302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  37.71 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  36.92 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  38.02 
 
 		 597 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  42.58 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  34.43 
 
 		 407 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  32.71 
 
 		 407 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  37.45 
 
 		 386 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06935  hypothetical protein  36.11 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  32.85 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  37.39 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  47.24 
 
 		 399 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  33.21 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  32.97 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  33.7 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  37.56 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  39.66 
 
 		 374 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  41.56 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  40.91 
 
 		 374 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6146  fatty acid hydroxylase  30.69 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  35.06 
 
 		 376 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1297  putative transmembrane protein  59.68 
 
 		 71 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.715305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.38 
 
 		 376 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.91 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>