241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2704 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  100 
 
 		 386 aa  785    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  65.32 
 
 		 380 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  43.06 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  43.99 
 
 		 373 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  43.99 
 
 		 374 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  43.72 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  45.51 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  41.16 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  42.02 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  42.02 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  42.21 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  44.22 
 
 		 301 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  40.12 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.62 
 
 		 291 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  31.15 
 
 		 282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  33.63 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  35.08 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  33.07 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  37.78 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  31.34 
 
 		 269 aa  94.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 305 aa  93.2  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.49 
 
 		 276 aa  92.8  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  30.09 
 
 		 284 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  35.81 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.35 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.23 
 
 		 281 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  34.19 
 
 		 282 aa  87  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.15 
 
 		 304 aa  86.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  32.98 
 
 		 287 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.93 
 
 		 283 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.97 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.75 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.91 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  30.43 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  32.61 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.61 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  32.22 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  29.46 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.34 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  32.43 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  36.18 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30.81 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.91 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  27.85 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  34.48 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  33.12 
 
 		 256 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  34.87 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  28.17 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  34.81 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.41 
 
 		 278 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  31.03 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  28.17 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.89 
 
 		 288 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.89 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  37.4 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  32.95 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.18 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  28.17 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.35 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  33.1 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  27.2 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  31.39 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  27.2 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  32 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  29.86 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30.61 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 		 256 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.8 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.97 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  32.69 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  26.72 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  30.48 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  32.05 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  30.48 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  28.93 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  31.87 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  31.36 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.7 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.6 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.7 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  27.72 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  30.87 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  33.12 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.92 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  29.87 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  29.29 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  32.52 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  32.11 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  26.91 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  29.67 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.05 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  29.17 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>