252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1983 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  56.11 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  55.43 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  55.73 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  51.92 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  53.94 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  51.92 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  50.2 
 
 		 281 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  49.62 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  53.56 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  51.78 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  52.55 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  49.22 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  48.64 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  49.8 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  46.21 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  46.51 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  47.26 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  46.54 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  45.35 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  46 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  44.71 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  43.7 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  44.66 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  41.57 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  45.78 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  37.3 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  41.92 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  35.74 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  34.68 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  39.11 
 
 		 289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  38.46 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  37.78 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  32.91 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  37.65 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.03 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  39.08 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  35.68 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.92 
 
 		 337 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  30.42 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  35.29 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.11 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  34.17 
 
 		 407 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.79 
 
 		 374 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.91 
 
 		 376 aa  88.6  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.06 
 
 		 374 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 401 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 401 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  34.25 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.06 
 
 		 373 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.06 
 
 		 373 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  29.29 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.06 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  32.91 
 
 		 386 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  32.03 
 
 		 385 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.64 
 
 		 380 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  29.54 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.19 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.91 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.36 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  32.19 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  32.48 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.17 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  25.7 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  26.05 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  32.73 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  32.03 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  35.07 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  32.03 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  32.03 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  29.34 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.82 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  30.94 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  27.92 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  31.43 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.76 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  27.45 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 526 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.39 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.36 
 
 		 320 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  28.95 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  29.55 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  28.95 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  30.43 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  28.95 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  33.1 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  33.1 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.24 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  27.49 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>