255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1104 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  67.2 
 
 		 283 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  63.26 
 
 		 270 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  63.75 
 
 		 330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  63.75 
 
 		 330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  58.97 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  57.4 
 
 		 292 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  56.47 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  59.22 
 
 		 256 aa  301  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  58.94 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  57.47 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  58.4 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  53.94 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  51.17 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  53.21 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  52.59 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  47.57 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  50.76 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  49.06 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  44.65 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  45.22 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  47.31 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  42.11 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  52.54 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  42.48 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  37.4 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  39.22 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  34.33 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  33.66 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  31.3 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  32.82 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.4 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  39.08 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  33.48 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  31.33 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  36.04 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 		 257 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  31.47 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  31.19 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.34 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  32.34 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.19 
 
 		 386 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.14 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.63 
 
 		 380 aa  89.4  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.61 
 
 		 376 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.94 
 
 		 374 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.95 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  29.76 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.38 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.87 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  24.19 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  24.19 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  24.19 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.98 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  26.6 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.68 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.2 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.88 
 
 		 597 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  31.94 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  33.11 
 
 		 431 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  29.78 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.42 
 
 		 374 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  25.53 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.88 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  31.98 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  28.65 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  34.09 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  29.59 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  30.56 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  32 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  29.46 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.02 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  30.32 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  26.25 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  27.98 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.17 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  27.47 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.55 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  25.98 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  29.09 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  29.09 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  30.71 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.47 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  29.87 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>