253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0427 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  57.08 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  57.08 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  52.46 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  54.7 
 
 		 270 aa  258  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  53.39 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  50.63 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  49.42 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  53.25 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  52.59 
 
 		 278 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  45.39 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  50.58 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  46.06 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  47.26 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  47.08 
 
 		 281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  50.6 
 
 		 282 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  45.35 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  46.9 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  46.3 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  47.15 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  49.81 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  41.29 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  47.26 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  43.59 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  41.9 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  42.02 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  41.3 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.98 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  32.13 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  35.95 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  36.24 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  36.59 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  35.78 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  35.07 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  37.86 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  28.79 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  33.17 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  34.5 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  40.48 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  32.04 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  35.62 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.59 
 
 		 376 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  35.17 
 
 		 376 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.13 
 
 		 374 aa  85.9  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.52 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  32.43 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.12 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  33.52 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.66 
 
 		 413 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.34 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  31.69 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  31.69 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  35.42 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.45 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  25.53 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  28.82 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  29.84 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.5 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  29.15 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  26.61 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.71 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  27.4 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  25.23 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  31.87 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.44 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.65 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  34 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  30.05 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  29.8 
 
 		 626 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  34.53 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  26.55 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.08 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  33.77 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  30.61 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  28.49 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  28.21 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  26.25 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30.67 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.63 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  26.48 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.71 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  28.29 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  31.61 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  30.14 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  24.2 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30.07 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  30.07 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30.07 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>