246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6885 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 413 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  44.96 
 
 		 400 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  36.27 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  34.2 
 
 		 269 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  37.41 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  36.95 
 
 		 301 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  37.72 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  36.46 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  37.14 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  35.92 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  41.13 
 
 		 296 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  38.14 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  37.14 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  37.14 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  34.3 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  36.75 
 
 		 282 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  36.71 
 
 		 298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  35.07 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.52 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.7 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.02 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.52 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.52 
 
 		 275 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  32.65 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  25.88 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  31.18 
 
 		 281 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  25.88 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  25.88 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.84 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 295 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.32 
 
 		 273 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.34 
 
 		 304 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  34.25 
 
 		 267 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  31.72 
 
 		 272 aa  87  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.22 
 
 		 273 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28.33 
 
 		 283 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.06 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  24.8 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  26.1 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  27.41 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  27.66 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  27.37 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  25.95 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  28.19 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  29.05 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  30.07 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  31.25 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  31.52 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  28.21 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.6 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  28.21 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  28.21 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  28.03 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.85 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.56 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  29.66 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  29.66 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.56 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  28.48 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  28.48 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.01 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.57 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  27.39 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.96 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  31.54 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  29.84 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  31.87 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.94 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  24.78 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  30.87 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.07 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  30.72 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.67 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  29.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  27.53 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.58 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  31.25 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  30.13 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  28.66 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  29.24 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>