237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05005 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  56 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  33.2 
 
 		 385 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  33.2 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  33.2 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.07 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  31.47 
 
 		 380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.54 
 
 		 374 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  33.06 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.91 
 
 		 373 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.37 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.22 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.67 
 
 		 376 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  31.28 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  30.14 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  33.96 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  32.05 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  32.58 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  28.24 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.76 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  32.89 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  27.52 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  35.71 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  32.91 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  31.4 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  31.4 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  31.4 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  30.67 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  30.81 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  30.94 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  29.14 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  26.44 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  33.12 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  33.12 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  32.24 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  24.9 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  30.94 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  30.67 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  30.67 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.65 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  34.42 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  32.19 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  29.44 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  33.79 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  29.94 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  29.94 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  28.31 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  24.81 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.2 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  29.19 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  31.51 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  31.51 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  31.58 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 304 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.41 
 
 		 304 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.01 
 
 		 314 aa  72  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  31.65 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  30.92 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  29.15 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  32.87 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  26.85 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  28.57 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.17 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  26.16 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  28.87 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  28.24 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  32.19 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  32.19 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32.19 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  31.28 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  29.26 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  30.06 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.54 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.64 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  28.92 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  27.68 
 
 		 324 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.11 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  33.9 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  28.14 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  28.37 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  28.37 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  29.59 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  28.29 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  27.72 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.23 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  31.37 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  28.24 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  28.98 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>