229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5005 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 326 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  71.12 
 
 		 328 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  66.87 
 
 		 320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  69.49 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  66.77 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  65.35 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  69.63 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  69.63 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  63.03 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  54.18 
 
 		 331 aa  351  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  54.15 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  55.08 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  56.47 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  54.46 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  47.3 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  48.26 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  48.26 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  47.63 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  47.63 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  47.63 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  47 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  47.63 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  47.63 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  46.69 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  46.69 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  46.69 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  46.37 
 
 		 324 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  47.32 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  47.32 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  47.32 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  46.98 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  41.19 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  38.82 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  36.25 
 
 		 324 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  38.31 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  36.74 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.8 
 
 		 291 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.9 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  28.72 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  31.07 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  32 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  34.09 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.75 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.87 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  32.58 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  34.01 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  27.6 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  30.72 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.81 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  31.61 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.66 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  29.41 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  33.55 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  29.48 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  29.89 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.06 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  30.58 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  26.58 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  29.26 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.41 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.8 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  30.72 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.81 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30.06 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30.06 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.84 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.84 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.52 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.84 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  30.06 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  29.81 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  24.8 
 
 		 273 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  30.14 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.84 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  26.37 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.62 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  30.36 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.17 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  25.65 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  26.26 
 
 		 264 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  24.34 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  24.34 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.75 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.95 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  28.65 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  24.34 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  28.86 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.59 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.74 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  25.24 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.59 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.59 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.75 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  28.65 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  26.24 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.18 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>