252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01793 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  50.19 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  47.17 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  47.92 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  44.32 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  41.51 
 
 		 330 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  41.51 
 
 		 330 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  38.87 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  38.31 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  39.62 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  39.42 
 
 		 273 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  41.06 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  41.3 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  40.15 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  40.3 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  39.54 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  39.45 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  36.84 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  40.87 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  38.26 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  40.07 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  37.75 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  37.3 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  39.25 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  37.4 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  39.64 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  32.2 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  37.93 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  32.26 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  35.23 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  37.68 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  39.13 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  33.2 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  35.63 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.17 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  29.06 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  36.93 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30.56 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  36.69 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  34.55 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.86 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.16 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  34.23 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.72 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.89 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  31.93 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.57 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  27.22 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.21 
 
 		 328 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  27.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  32.53 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  31.61 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.07 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  25.87 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.71 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  25.25 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  30.68 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.79 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  28.74 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.9 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  29.75 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.65 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  27.87 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  32.33 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  27.91 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.17 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  27.81 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  27.81 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  28.86 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  34.46 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  30.94 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.85 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.85 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  25.6 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  24.83 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.47 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  29.31 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  25.2 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  25.2 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  25.2 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  29.48 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  31.47 
 
 		 400 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  28.42 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  28.77 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  26.98 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>