222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2066 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  84.29 
 
 		 324 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  66.98 
 
 		 324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  67.28 
 
 		 324 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  68.63 
 
 		 324 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  57.83 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  56.13 
 
 		 328 aa  358  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  54.18 
 
 		 326 aa  351  8.999999999999999e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  52.17 
 
 		 320 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  53.21 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  50.77 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  49.84 
 
 		 329 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  54.4 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  48.6 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  48.6 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  48.6 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  48.29 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  47.98 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  55.87 
 
 		 332 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  48.91 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  48.91 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  48.91 
 
 		 329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  47.65 
 
 		 332 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  54.6 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  47.66 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  47.66 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  48.6 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  48.6 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  48.6 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  48.01 
 
 		 327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  47.65 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  44.98 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  40.97 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  38.71 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  37.75 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  38.84 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  37.71 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  31.43 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.08 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  29.28 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  29.28 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  29.28 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.28 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  26.19 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  33.73 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  26.19 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  30.68 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.01 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.67 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  34.09 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  26.91 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  26.88 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  29.73 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  30.5 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  32.12 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  33.76 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.56 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  31.43 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.05 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  28.38 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  27.8 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  31.79 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.88 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.49 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.09 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  30.57 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  32.19 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  30 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  30 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  27.46 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  30 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  29.5 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.44 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.8 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  31.71 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.53 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  27.46 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  26.64 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  29.67 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.17 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  35.06 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29.89 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  30.46 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.46 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.69 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  28.98 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  31.45 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  27.67 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.49 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.98 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.38 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>