229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1082 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 324 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  95.68 
 
 		 324 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  89.81 
 
 		 324 aa  577  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  67.28 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  68.24 
 
 		 324 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  56.92 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  55.66 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  54.49 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  53.85 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  55.08 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  56.44 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  52.87 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  50.79 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  55.08 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  54.46 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  50 
 
 		 332 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  51.13 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  50.96 
 
 		 325 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  50.96 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  50.64 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  50.64 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  50.64 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  49.85 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  49.52 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  49.36 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  49.36 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  49.52 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  49.52 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  50 
 
 		 332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  49.2 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  49.2 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  49.2 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  38.46 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  38.94 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  36.45 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  39.87 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.6 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  31.44 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  28.26 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  25.33 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.63 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  25.33 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  25.33 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  24.22 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  25.33 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28.76 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  39.16 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.57 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  28.83 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  28.64 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.87 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  30.2 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  28.94 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.07 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.08 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.14 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  31.82 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  26 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  28.42 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  29.27 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.41 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  24.38 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  32.89 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  25.73 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  26.3 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  26.3 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.86 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  27.04 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.68 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  28.41 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  28.41 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  29.79 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  29.55 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  28.66 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.24 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.84 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.89 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  28.41 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  27.46 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.66 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  27.88 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  29.59 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  28.93 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.38 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.1 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  27.88 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  33.33 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.49 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  27.84 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  27.78 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  23.87 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.76 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>