233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2695 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  96.35 
 
 
329 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  99.7 
 
 
329 aa  668    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  99.7 
 
 
329 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  99.7 
 
 
329 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  83.89 
 
 
325 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  83.59 
 
 
324 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  83.59 
 
 
324 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  83.59 
 
 
324 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  83.28 
 
 
324 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  82.97 
 
 
324 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  82.97 
 
 
324 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  74.47 
 
 
332 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  74.77 
 
 
332 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  73.7 
 
 
327 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  51.91 
 
 
324 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  48.91 
 
 
331 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  47.95 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  49.2 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  49.37 
 
 
328 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  49.22 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  47.28 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  47.63 
 
 
326 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  49.52 
 
 
324 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  49.2 
 
 
324 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  45.71 
 
 
331 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  47.04 
 
 
324 aa  278  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  47.5 
 
 
332 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  46.88 
 
 
332 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  40.62 
 
 
323 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  41.56 
 
 
308 aa  245  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  39.31 
 
 
324 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  37.33 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  36 
 
 
297 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  31.53 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.72 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  31.82 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.88 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.05 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.05 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  29.47 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  26.57 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  28.14 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.69 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  31.94 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.46 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.94 
 
 
278 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.61 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  30.25 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.12 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  29.28 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  33.57 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  32.39 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.03 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  26.75 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.03 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.22 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  27.81 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  32.12 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.81 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  31.34 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.36 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.43 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.85 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  26.74 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  30.56 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  28.26 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  24.28 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  30.07 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  29.61 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  30.3 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  24.03 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  29.49 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  29.49 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.61 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  28.78 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  31.29 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  30.14 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  28.39 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  26.35 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  37.14 
 
 
597 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.41 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  37.14 
 
 
597 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  26.52 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  28.5 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  28.03 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  23.38 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  29.8 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  27.42 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>