232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1517 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  96.39 
 
 
332 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  88.54 
 
 
327 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  75.68 
 
 
329 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  74.77 
 
 
329 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  74.77 
 
 
329 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  74.77 
 
 
329 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  74.47 
 
 
329 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  74.47 
 
 
329 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  74.47 
 
 
329 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  73.39 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  73.39 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  73.39 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  73.7 
 
 
324 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  72.64 
 
 
325 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  71.87 
 
 
324 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  71.87 
 
 
324 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  50 
 
 
324 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  50.63 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  47.65 
 
 
331 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  51.57 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  46.2 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  46.98 
 
 
326 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  50 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  47.95 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  47.81 
 
 
324 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  44.65 
 
 
328 aa  299  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  45.57 
 
 
331 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  46.89 
 
 
324 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  45.32 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  45.02 
 
 
332 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  38.96 
 
 
323 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  43.45 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  40.13 
 
 
324 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  35.44 
 
 
374 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  36.5 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.59 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.87 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  35.37 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  29.75 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  32.18 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  29.61 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  29.75 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  30.81 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.77 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.25 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.32 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.84 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  28.23 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  26.38 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.72 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.74 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  29.81 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  25.71 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.21 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  25.98 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  30.49 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.92 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.57 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  27.59 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  30 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  26.98 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  32.92 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.3 
 
 
431 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  26.45 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  26.29 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.66 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  29.41 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  32.52 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  29.3 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  31.09 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  26.58 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.81 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.13 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.82 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  34.59 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  33.8 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  35.86 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  35.61 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  35.53 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  25.44 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  28.8 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  25.59 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  26.95 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  32.7 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  25.47 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5310  fatty acid hydroxylase  26.52 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000145361  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  34 
 
 
430 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  26.35 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  33.1 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  29.87 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.33 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  34.52 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  27.74 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>