243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11823 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  56 
 
 		 256 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.39 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  33.71 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  33.71 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  29.12 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  32.82 
 
 		 385 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  33.46 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.62 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.54 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  36.16 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.02 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  34.44 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  29.66 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.11 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  28.98 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.11 
 
 		 373 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.11 
 
 		 374 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.11 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  33.71 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  32.04 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.39 
 
 		 295 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  29.39 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  29.8 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.96 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  26.9 
 
 		 321 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  30.29 
 
 		 328 aa  92  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  29 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  31.94 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.73 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  29.89 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.18 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  27.39 
 
 		 324 aa  85.5  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28.69 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.6 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  34.67 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  32.72 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  33.96 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  28.98 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.36 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  24.7 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  26.91 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  34.67 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.74 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.68 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  32.7 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  28.33 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.11 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  27.6 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.67 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  28.63 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  28.04 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  28.04 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  21.17 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  31.76 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  31.76 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  29.32 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  27.66 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.51 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.53 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  24.45 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  31.79 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  31.13 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  29.94 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.03 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  31.79 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  31.79 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  25.93 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.64 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  34.04 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  29.18 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  29.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  29.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.71 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  29.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  29.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  29.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  29.46 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  30.32 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  36.67 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  20.51 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  34.29 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.41 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  26.59 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  22.68 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  29.72 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  29.83 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.22 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  29.83 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  32.41 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.22 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  32.41 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>