245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0347 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
293 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.62 
 
 
376 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.75 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.71 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  30.23 
 
 
386 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.92 
 
 
385 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.39 
 
 
291 aa  126  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.13 
 
 
401 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 
373 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.13 
 
 
401 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
373 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
374 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
301 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  32.09 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  29.7 
 
 
413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  27.65 
 
 
256 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  35.48 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  34.25 
 
 
282 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.52 
 
 
304 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.9 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.78 
 
 
376 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  27.48 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.42 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.93 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  34.38 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  28.74 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.85 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  32.08 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.77 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.43 
 
 
400 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.14 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  31.95 
 
 
278 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  27.44 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  30.26 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  25.89 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  30.59 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.87 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.13 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  26.36 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  31.75 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  28.5 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.18 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.18 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  31.34 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  29.38 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  33.54 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  29.59 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  29.46 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  27.74 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  31.45 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  29.02 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  25.73 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  30.37 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  33.12 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  27.39 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  26.04 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  32.48 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  28.08 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.77 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  28.63 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  28.21 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  28.21 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  28.28 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  30.73 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  27.87 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  27.31 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  27.08 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  31.82 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  28.89 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  28.14 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  30.1 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  27.88 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  27.98 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  30.15 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  28.69 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  28.28 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  28.36 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  27.98 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  27.98 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.93 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.51 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  34.04 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  27.95 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  28.8 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  28.05 
 
 
430 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  32.58 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  29.56 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  29.56 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  28.06 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  27.18 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  27.31 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  31.65 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  30.91 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>