230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4808 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  597  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  95.41 
 
 
301 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  64.33 
 
 
296 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  55.51 
 
 
269 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  52.98 
 
 
284 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  63.8 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  48.49 
 
 
303 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  49.1 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  46.81 
 
 
320 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  49.3 
 
 
305 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  46.41 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  46.41 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  44.01 
 
 
323 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  44.01 
 
 
323 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  53.19 
 
 
298 aa  245  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  47.16 
 
 
322 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  47.16 
 
 
322 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  47.16 
 
 
322 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  47.7 
 
 
295 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  37.89 
 
 
413 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  41.83 
 
 
400 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.88 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  32.18 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.96 
 
 
385 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 
401 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 
401 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.4 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.39 
 
 
281 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  31.58 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.27 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 
376 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  34.29 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  31.16 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  32.11 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.69 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32.42 
 
 
380 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.05 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.68 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  30.99 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  35.79 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.49 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.53 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  31.35 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.53 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.53 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.68 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  26.6 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.53 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  32.8 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  31.94 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  35 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  30.46 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  30.56 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  31.45 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  28.32 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  32.14 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  30.56 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  30.56 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.1 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  30.73 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  25.54 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  30.43 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  30.56 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.97 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  26.82 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  31.21 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  31.21 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  32.14 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.09 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.86 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  32.86 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  32.86 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  28.89 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  29.08 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  27.98 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32.14 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  29.06 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  25.58 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.89 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  30.54 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.89 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.37 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.12 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  28.49 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  26.23 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  33.71 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  29.17 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  29.09 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  33.8 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.12 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  32.75 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  33.71 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  32.14 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  29.09 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  33.58 
 
 
271 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  29.09 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  26.63 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>