251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3994 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  91.37 
 
 		 256 aa  477  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  66.79 
 
 		 264 aa  339  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  58.09 
 
 		 283 aa  292  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  59.22 
 
 		 278 aa  291  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  55.6 
 
 		 330 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  55.6 
 
 		 330 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  57.14 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  55.43 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  55.77 
 
 		 267 aa  281  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  57.92 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  55.2 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  51.34 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  49.81 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  51.65 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  49.42 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  46.56 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  46.74 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  46.72 
 
 		 282 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  45.77 
 
 		 273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  45 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  41.98 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  40.68 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  46.05 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  39.54 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  39.54 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  42.23 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  33.73 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  34.14 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.16 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  39.59 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  37.93 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  36.21 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  37.98 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  35.75 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  42.42 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  38.12 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.49 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  30.85 
 
 		 276 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.18 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.9 
 
 		 328 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  35.42 
 
 		 380 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  31.72 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.21 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  36.84 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.41 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  31.61 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.12 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  33.78 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  33.54 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  31.77 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  32.68 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  31.68 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.2 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  29.56 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  30.91 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30.25 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30.25 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30.06 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.65 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30.25 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30.06 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30.06 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.21 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  29.27 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  26.49 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  26.49 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  26.49 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  25.62 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.49 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  28.66 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  29.88 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  28.29 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.88 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  28.74 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  31.61 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  34.51 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  26.16 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  27.56 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4845  fatty acid hydroxylase  28.22 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  32.84 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  31.91 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  30.32 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  27.81 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 374 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  29.5 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  31.84 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>