259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003512 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  78.07 
 
 		 281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  62.2 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  55.6 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  52.83 
 
 		 267 aa  285  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  54.65 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  53.97 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  53.94 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  53.94 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  53.21 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  52.96 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  50.58 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  50.39 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  53.36 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  49.43 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  53.28 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  45.35 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  47.21 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  50 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  45.56 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  45.45 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  42.38 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  48.52 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  43.02 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  43.75 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  40.94 
 
 		 259 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  40.15 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  31.91 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  37.19 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.06 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  32.68 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  34.41 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.48 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  32.73 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  30.97 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  29.85 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  32.51 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  32.95 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  33.18 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.63 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  30.87 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  28.32 
 
 		 380 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  33.93 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  35.86 
 
 		 376 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30.32 
 
 		 413 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  33.1 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 373 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 373 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 374 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.11 
 
 		 386 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 401 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 401 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.1 
 
 		 374 aa  89.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.63 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  27 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  27.1 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  32.58 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.32 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  29.73 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  26.47 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  26.83 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  27.08 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  25.33 
 
 		 386 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.34 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  28.65 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  27.33 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.98 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  27.23 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.06 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  27.66 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  26.7 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  26.17 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  26.61 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  26.61 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.08 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  26.03 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  28.38 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  26.15 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  27.85 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  30.05 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.52 
 
 		 626 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.25 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  28.93 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.92 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  32.43 
 
 		 597 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  26.7 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  26.03 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  31.76 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>