203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3135 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3134  sterol desaturase-like  50.99 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.278147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  31.82 
 
 		 328 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.74 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  28.97 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  30.73 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  30.72 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  29.94 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  32.72 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.93 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.24 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  28.7 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.37 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.06 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4274  hypothetical protein  29.06 
 
 		 412 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  32.1 
 
 		 431 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.48 
 
 		 431 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  32.32 
 
 		 305 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  29.82 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.19 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  31.21 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.88 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  30.54 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  29.85 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  30.59 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  30.23 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  28.49 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  29.75 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  28.17 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.41 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  30.25 
 
 		 431 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.61 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.36 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  27.52 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  29.56 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.14 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  29.33 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1074  fatty acid hydroxylase  27.59 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  29.27 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3171  sterol desaturase-related protein  29.17 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.0471796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  28 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  26.51 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  28.81 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  29.03 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  27.81 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  29.53 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  30.82 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  28.51 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  30.86 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1221  hypothetical protein  34.48 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  28.4 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.22 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.56 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  26.97 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  26.97 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  26.97 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  26.97 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  27.71 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  29.34 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  27.03 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  31.94 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  29.07 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  30.41 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  31.25 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  28.05 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  30 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  30.5 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  25.6 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  26.19 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  25.57 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  27.95 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  27.78 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  27.78 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  26.79 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  25.61 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  29.07 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  29.41 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  27.63 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  23.87 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  25.79 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  25.14 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  25.14 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  23.89 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  29.88 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  27.98 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  25.11 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  28.24 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>