186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0615 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  100 
 
 
331 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  42.03 
 
 
306 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  26.02 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2901  fatty acid hydroxylase  28.7 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800123  normal  0.025383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  28.64 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  30.5 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.27 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  27.51 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  30.95 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  27.53 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  26.72 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  25.56 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  27.24 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.66 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  25.42 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  28.51 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  30.88 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  30.88 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  30.43 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.98 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  30.88 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  27.75 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6122  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  27.95 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.88 
 
 
385 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  24.36 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  30.26 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3860  hypothetical protein  30.34 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30.56 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  29.14 
 
 
374 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  28.5 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  31.52 
 
 
287 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  25.63 
 
 
400 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  28.17 
 
 
304 aa  62.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  28.88 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  29.08 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  25.22 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  31.52 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  26.17 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  26.17 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.91 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  30.99 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  30.86 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1294  fatty acid hydroxylase  30.15 
 
 
298 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.443981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  28.31 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.32 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0297  sterol desaturase-like protein  27.98 
 
 
430 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  32.45 
 
 
282 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.79 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1096  fatty acid hydroxylase  26.28 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354603  normal  0.159739 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  26.32 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  28.48 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.61 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  29.55 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  24.57 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  23.18 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.5 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  29.03 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  27.32 
 
 
282 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  30.3 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  28.95 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  28.85 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  29.41 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  29.41 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.4 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  29.5 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  29.5 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  29.47 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  29.55 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  29.55 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  29.55 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  25.84 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.36 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  25.69 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  29.85 
 
 
314 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  27.56 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  27.46 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  29.41 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  24.4 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  30.67 
 
 
431 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.67 
 
 
431 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  25.65 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.84 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  25.44 
 
 
281 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  28.07 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  29.55 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  26.67 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.39 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  28.3 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  30.64 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  27.03 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  26.54 
 
 
426 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>