243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1138 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  100 
 
 		 304 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  35.86 
 
 		 374 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  36.64 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  32.2 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  37.7 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  32.64 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  32.64 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  32.64 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  32.23 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.13 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.13 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.77 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  37.33 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  37.61 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  33.63 
 
 		 386 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.52 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.49 
 
 		 275 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.22 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  32.34 
 
 		 413 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  32.98 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  34.01 
 
 		 310 aa  85.9  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  34.84 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  34.21 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  30.14 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  26.73 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  33.97 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.6 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.38 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  33.74 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  36.36 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  33.15 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  33.15 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  33.15 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  29.49 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  35.03 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  35.03 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  30.8 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.75 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  35.15 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  35.95 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.81 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.61 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  34.39 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  33.06 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  34.18 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  34.55 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  36.94 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  34.55 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  35.03 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  26.42 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  31.76 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  34.32 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  30.3 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4648  sterol desaturase-like protein  29.94 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  35.19 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  32.94 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  30.16 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  29.31 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  27.51 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.07 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  35.19 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  32.28 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  30.41 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  31.74 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  27.36 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  30.39 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  32.69 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  32.4 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  31.64 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0469  sterol desaturase-related protein  25.87 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.93302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  32.1 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  30.65 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  29.05 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  27.87 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  30.39 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  32.97 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  30.86 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  25.82 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4507  fatty acid hydroxylase  28.16 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  32.52 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  31.29 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.51 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  32.48 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  33.77 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  29.82 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  32.1 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  31.17 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  33.13 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  33.13 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  32.52 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  33.13 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  32.87 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  30.39 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0371  putative transmembrane fatty acid synthesis protein  34.86 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  32.1 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>