262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2354 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  100 
 
 		 400 aa  793    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  38.74 
 
 		 413 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  39.66 
 
 		 305 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  38.53 
 
 		 269 aa  159  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  42.51 
 
 		 301 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  35.25 
 
 		 324 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  38.57 
 
 		 284 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  35.25 
 
 		 324 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  36 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  40.26 
 
 		 295 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  37.09 
 
 		 318 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  37.77 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  41.43 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  34.64 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  34.64 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  39.24 
 
 		 298 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  35.17 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  33.93 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  39.74 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  40.15 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  33.33 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  29.13 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  38.01 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.03 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  33.53 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.3 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.3 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  36.25 
 
 		 267 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.24 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  30.43 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  30.4 
 
 		 304 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  34.73 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  35.09 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0224  hypothetical protein  38.68 
 
 		 136 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  29.73 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28.96 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.18 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02038  beta-lactamase domain protein  43.33 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4224  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  30.11 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  32.88 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  30.98 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  32.1 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.36 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  32.1 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  32.1 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  31.29 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  28.97 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  29.38 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  33.54 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  29.56 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0608  hypothetical protein  34.58 
 
 		 112 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  36.88 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  35.06 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.25 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.93 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  34.75 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  34.67 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.68 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  36.5 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.6 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  31.35 
 
 		 274 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  33.83 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  31.61 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.3 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  32.69 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2520  hypothetical protein  43.33 
 
 		 122 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  26.27 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  32.43 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  29.59 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  26.38 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  31.82 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.68 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  33.14 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  33.78 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.22 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  30.46 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  32.65 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.87 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  24.63 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  28.16 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  28.16 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  28.16 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  33.11 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.11 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  28.16 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  30.07 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  29.59 
 
 		 288 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4869  hypothetical protein  44.09 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.47 
 
 		 265 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  31.91 
 
 		 292 aa  67  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  27.16 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  31.98 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  29.03 
 
 		 218 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>