243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0647 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 373 aa  756    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  99.2 
 
 		 374 aa  751    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  99.73 
 
 		 373 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  99.34 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  59.1 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  58.54 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  55.59 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  55.59 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  55.15 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  43.1 
 
 		 376 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  43.72 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  41.06 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3740  hypothetical protein  98.59 
 
 		 84 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  32.23 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  39.08 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  31.11 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.91 
 
 		 256 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  34.88 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  27.27 
 
 		 282 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  27.76 
 
 		 269 aa  95.9  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.6 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.21 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  34.23 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  27.3 
 
 		 284 aa  92.8  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.85 
 
 		 267 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  35.29 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.1 
 
 		 321 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  32.31 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.85 
 
 		 273 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  26.67 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  28.7 
 
 		 273 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  33.99 
 
 		 304 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  34.9 
 
 		 218 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  34.9 
 
 		 218 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  36.91 
 
 		 305 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  33.99 
 
 		 321 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  30.11 
 
 		 284 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  36.91 
 
 		 305 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  36.91 
 
 		 305 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  36.24 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  33.33 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.68 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.44 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  35.97 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.05 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  33.75 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  27.96 
 
 		 274 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  28.34 
 
 		 259 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  31.25 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  33.79 
 
 		 267 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  32.68 
 
 		 304 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  32 
 
 		 257 aa  86.3  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  31.87 
 
 		 272 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.56 
 
 		 270 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.94 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  34.38 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  25.44 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  28.44 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.46 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  33.56 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  32.03 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  33.09 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  34.04 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  33.53 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  25.1 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.77 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  31.96 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  33.57 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  32.73 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  30.37 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  25.66 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  28.86 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  31.14 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  26.49 
 
 		 256 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  25.99 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  28 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  32.28 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  31.18 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  26.36 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  28.07 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  31.71 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  32.34 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  36.55 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  33.57 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  28.31 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  24.34 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  26.51 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>