249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0028 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  48.76 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  36.75 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  34.8 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  33.76 
 
 		 400 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  33.88 
 
 		 380 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  37.33 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  35.19 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  32.47 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  31.15 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.97 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.97 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  30.83 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  39.05 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  27.89 
 
 		 385 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  33.48 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  34.25 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  32.11 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.8 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  31.6 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 376 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  31.84 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  31.84 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  34.25 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  32.18 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  32.44 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.14 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  34.03 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  35.87 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  33.33 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  37.21 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  40.69 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  27.42 
 
 		 373 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  34.75 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  27.42 
 
 		 374 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  37.66 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  27.42 
 
 		 373 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  26.4 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  36.25 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  33.53 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  31.17 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.28 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  31.25 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  35.22 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  36.88 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  28.17 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  35.42 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  35.29 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  35.66 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  30.94 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  32.97 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  34.55 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  32.47 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.03 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  34.57 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  31.85 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  35.33 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  25.2 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  36.81 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  33.33 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  34.75 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  28.74 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  33.12 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  33.12 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  33.12 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.52 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  35 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  31 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  32.62 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.62 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  34.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  34.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.58 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  35.07 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  31.68 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  35.44 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  28.99 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  31.68 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  34.23 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  32.08 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  34.33 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  33.1 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  25 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3822  hypothetical protein  38.1 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  33.12 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  28.45 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  30.38 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.06 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>